亞東醫院將基因定序搬上雲端，推進精准醫療新階段

亞東紀念醫院近期宣佈，已將核心基因定序雲端系統成功建置於 Microsoft Azure 台灣區域，成為臺灣首座一級醫學中心實踐雲端運算的案例。此次合作由台灣微軟與亞大基因科技共同參與，目標是以可擴充的雲端計算能力及自動化流程，強化基因資料分析效率，加速精準醫療和臨床研究的發展。

隨著健保署自 2024 年起將次世代基因定序（NGS）納入給付，台灣每年約有兩萬名癌症患者能接受相關檢測。這使得醫療現場對基因資料分析的需求快速上升。然而，基因定序產生的數據量巨大，一次檢測可能達 100GB 以上，包含數十萬個基因變異點，因此穩定可靠的運算能力和資料管理架構對於取得臨床判讀所需資訊至關重要。

亞東醫院指出，將核心基因定序系統搬上雲端是必要的方向。該院近年積極推動精準醫療研究，已建立大型基因資料庫，累積超過一萬名受檢者的數據，在院內正式啟動跨科室的「精準醫療計畫」。這些數據未來將成為健康管理與風險分析的重要基礎。

亞東醫院採用亞大基因科技 Atgenomix Seqslab 平台，通過多項 Azure 服務打造雲端架構，包括 Azure Data Lake Storage Gen2、Azure Database for MySQL、Azure Kubernetes Service（AKS）、Azure Container Services 和 Azure Batch。這些系統已通過 ISO 27001、27018、13485、62304 等國際資安與醫療軟體認證，有助於醫院在高度敏感的基因資料環境中維持穩定的治理流程。

借助 Azure GPU 運算與 NVIDIA Parabricks 加速分析，亞東醫院基因分析處理時間大幅縮短。例如，30 倍全基因定序（WGS）分析時間由約 4 小時縮短至 10 分鐘；2,500 名受檢者的聯合分析由過去一個月縮短為 40 小時，效率提升 16 倍。

在臨床應用方面，SQL 查詢效率也顯著提高。針對一萬名受試者、90 億筆變異數據的資料庫查詢，平均時間從 140 秒降至 12 秒，這使得臨床醫師判讀資料及進行跨科室討論時更有效率。

將資料湖與運算工作負載落地 Azure 台灣區域後，亞東醫院能在本地完成資料儲存與分析，符合醫療法規，並減少跨地域傳輸所造成的延遲。目前基因定序系統已應用於心血管疾病、神經系統疾病、遺傳性及罕見疾病分析以及癌症照護資料整合等多項疾病研究。

未來亞東醫院計劃拓展至更多研究領域，包括腸道菌、失智症等，持續推動精準健康管理的落地。