亞東醫院將基因定序系統上雲 推進精准醫療新篇章

亞東紀念醫院與台灣微軟及亞大基因科技攜手合作，成功打造「亞東精準醫療永續平台」，加速推進精確化的醫學研究與臨床應用。透過將核心基因定序系統上雲，該平台採用 Azure 雲端技術，不僅提升分析效率，還強化了安全性和合規性。亞東醫院副院長張至宏、亞大基因科技執行長張明台以及台灣微軟雲專案總經理蔡琮裕等參與了此次合作的啟動儀式。

此平台利用 Azure 的強大功能，提供彈性擴充的算力和自動化機制，在低延遲且安全的雲原生環境中快速處理基因定序數據。它有助於識別基因變異高風險族群並進行健康管理，並在健康、亞健康到發病的不同階段提供臨床參考，支持早期預警與適時介入。亞東醫院也因此成為台灣首個將核心基因定序系統導入雲端的一級醫學中心，為未來精準醫療的推進奠定了重要基礎。

根據衛福部健保署計劃，自 2024 年起次世代基因定序（NGS）檢測將納入健保給付範圍。預計每年約有兩萬名癌友受惠。亞東醫院積極配合此政策，在院內啟動精準醫療計畫，並累積了超過一萬名受檢者的基因資料庫。該醫院醫學研究部院長邱冠明指出，亞東正在邁向數位轉型和精確醫學的時代，通過整合大數據分析能力，進一步提升患者的健康保障。

隨著合作深入，亞東醫院與亞大基因科技共同開發了 Bio-IT 雲端平台服務 Atgenomix Seqslab。該系統基於 Microsoft Azure 技術搭建，集成了多項 Azure 服務如 Data Lake Storage Gen2、Database for MySQL 等，同時通過 ISO 27001、27018 等資安認證，確保數據的安全性與隱私保護。

台灣微軟總經理卞志祥表示，亞東醫院成為亞洲首例將癌症和遺傳罕見疾病基因定序分析運算建置於 Azure 平台的案例。雲原生架構及低延遲、可彈性擴充的計算能力，使得龐大的基因數據得以轉換為即時洞見。

另一方面，系統利用 NVIDIA Parabricks 加速基因體分析過程，提升處理效能。例如，在 30 倍深度全基因定序（WGS）的變異點偵測中，使用 80 台裝有 NVIDIA T4 GPU 的 Azure 虛擬機，可將原本約 4 小時的分析時間縮短至僅 10 分鐘。對於 2,500 名受檢者的全基因體定型（WGG），則可在 40 小時內完成，較傳統方法效率提高 16 倍。

此外，系統還強化 SQL 查詢效能，能夠快速處理涵蓋逾一萬名受試者、總計達 90 億筆變異資料的數據庫。這大大節省了臨床醫生的等待時間，提升了基因檢測與決策效率。

隨著政策推動和技術革新，亞東醫院將其基因定序系統部署至微軟在台區域資料中心，確保符合本地醫療法規與資安標準。此舉不僅提升分析效率和安全性，還有助於實現快速啟動分析與查詢。目前該院已將基因定序系統應用於心血管疾病、神經系統疾病及罕見疾病的臨床研究中，並配合國家生物資料庫計畫，擴展至腸道菌基因與失智症關聯研究等新領域。

亞東醫院通過這次合作，不僅提升了自身的精確醫學能力，還為台灣的精准醫療推進設立了先驅。